设为首页收藏本站
开启辅助访问 切换到宽版 登录 注册

QQ登录

只需一步,快速开始

龙华针灸

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 2526|回复: 0
打印 上一主题 下一主题

大牛的高颜值科研图片竟是用 PPT 做的

[复制链接]

86

主题

85

帖子

372

积分

中级会员

Rank: 3Rank: 3

积分
372
QQ
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2018-9-21 14:42:03 | 只看该作者 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式


转载







1
有时候你需要的可能只是一些耐心
PPT 中插入的图形只是一些标准图形。比如,三角形,正方形等等。这些图形可以满足一些基本需求。但有时候,我们需要的不仅仅是基本图形。
比如,我需要一篇叶子,一颗植物,一个形状怪异的蛋白质亚基。这时候,标准图形就显得很无力。
我们需要一些改变。好在,PPT 中提供了这样一项功能。插入标准图形后,右击鼠标你会发现有个「编辑顶点」的功能。
我们可以利用这项功能,去画一片叶子,一株植物,一个形状奇特的蛋白亚基。于是,我画了几片叶子,用这几片叶子组装成一株拟南芥。
这是比较简单的应用。如果能把通过绘图把实验数据可视化,那么,这个方法做出来的图,将会显得更高级。
比如,有一段时间,我得到一批 RNA-seq 数据,里面有许多差异化表达的基因,通过分析发现许多差异化表达的基因编码的蛋白都用来组装光系统蛋白。常用的 RNA-seq 数据可视化的方法是 Heatmap(热图)。于是,我做了一个热图。
Heatmap(热图)表示的基因差异化表达

然而,我总觉得缺少了什么。要不我就画一张光系统的图吧。因为,组成光系统的蛋白亚基是分别由叶绿体基因和细胞核基因编码的。在这张图中,
我需要:
1. 在这张图里面先分别标注哪些蛋白质是叶绿体基因编码的,哪些蛋白是细胞核基因编码的;
2. 标注出实验中观察到的,叶绿体基因和细胞核基因的差异化表达。
利用这个「编辑顶点」功能,我首先可以画一个磷脂酸双分子层的膜结构,以及一堆蛋白质亚基:
磷脂双分子层
接着,你可以把这些组装起来(绿色的部分,就是由叶绿体基因编码的蛋白亚基)

植物叶绿体中的光系统,绿色为光合作用相关的叶绿体基因。

从一个亚基到光合作用系统的绘制过程 GIF 图

最后,把这些图精修一下,加上自己的实验数据(每个编码每个亚基的基因表达水平)就可以了。

(LHC: Light harvest complex protein(光吸收复合体); PhANGs: photosynthesis associated nuclear genes(光合作用相关细胞核基因); PhAPGs: photosynthesis associated plastid genes(光合作用相关的质体基因))

这样,比起 Heatmap,我将基因差异化表达更加实体化,数据一目了然。利用简单的「编辑顶点」的功能,我们从简单的画一片叶子,到画一个比较复杂的图,把基因表达数据可视化,用简单的功能,做出比较高级的图。




本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

x
分享到:  QQ好友和群QQ好友和群 QQ空间QQ空间 腾讯微博腾讯微博 腾讯朋友腾讯朋友
收藏收藏 转播转播 分享分享 分享淘帖
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|小黑屋|手机版|Archiver|龙华针灸    

GMT+8, 2026-7-17 20:32 , Processed in 0.140625 second(s), 28 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表